Waalkens vraagt nadrukkelijk om meer dan een gewone evaluatie. Hij wil aandacht voor de in zijn ogen belabberde communicatie tussen de ministeries van Volksgezondheid en Landbouw en de manier waarop die departementen vervolgens de Voedsel en Waren Autoriteit (VWA) aanstuurden. „Ook alle momenten van besluitvorming en momenten van nieuwe ontwikkelingen waarbij geen besluitvorming volgde vanaf 2007 ”, wil hij op een rijtje hebben. De PvdA’er vindt een volstrekt onafhankelijk onderzoek nodig om een gewogen politiek oordeel te kunnen maken. Hij kreeg bijval van SP , GroenLinks en D66. Volgens Verburg worden die zaken meegenomen in de evaluatie.
Het CDA, ChristenUnie en SGP willen wel onderzoek. Maar zij stellen: „Tijdens een brand moet je de brand blussen en niet gaan evalueren. Er zijn natuurlijk lessen te leren, maar het gaat er nu om de Q–koorts te minimaliseren”, stelde Henk Jan Ormel (CDA). De ChristenUnie sloot zich daarbij aan. De kleinste coalitiepartij vindt dat terugblikkend op de ontwikkelingen rond de Q–koorts het beeld opdoemt van een traag handelende overheid. Hadden we eerder krachtig kunnen ingrijpen, vraagt Cramer (CU) zich af.